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高温蒸汽处理属非焚烧技术，其基本原理为湿热灭菌，即在汽液饱和状态下利用水蒸汽的热量使菌体蛋白质变性、凝固，从而使病源微生物死亡。其基本过程为：将待处理的医疗废物放置在灭菌器内，灭菌器密闭后，充入高温蒸汽，使灭菌室到达规定的灭菌温度，并保持足够的灭菌时间，从而完成热力杀菌过程。为了减少灭菌器内原有空气对灭菌效果的影响，一在蒸汽通入前，将空气经过滤除菌后排除到灭菌器外。而蒸汽冷凝后产生的少量废液（仅占医疗废物处理量的5%）也随同医疗废物进行灭菌，该小部分废液已无传染性危害，可以随同其他生产废水，采用常规的方法进行处理。因此，高温蒸汽对医疗废物的处理过程是对气、固、液同时灭菌的过程。